自凈化藥品柜的作業(yè)很大一部分要得益于內部的過濾器，這這種過濾又分為粉塵過濾和溶劑過濾兩類，首先柜內空氣先通過粉塵過濾將空氣中粉末類灰塵和化學品過濾，其次，通過活性炭分子過濾器過濾液體分子。針對超凈室，還要裝備HEAP粒子過濾器，以保證碳粉等顆粒物進入試驗室損壞潔凈環(huán)境。
這些進程聽起來似乎很復雜，其實簡略地說即是，將藥品柜內部揮發(fā)性和腐蝕性化學藥品散宣布的有毒有害氣體進行吸收并凈化，然后能夠再次進入空氣中進行再循環(huán)，以到達凈化空氣、保護環(huán)境的意圖。
自凈化藥品柜存放藥品的方法和要求：
首先需要列明在藥品柜里需存放的所有化學品。因為活性炭過濾器并非吸附所有的化學品，所以我們首先要判定我們要存儲的化學藥品是否有效被過濾。
其次要確認每種化學品的安全特性。用戶通過MSDS（化學品安全技術說明書），可以在藥品柜中安全貯存化學品。
再次通過不兼容表判斷是否有不兼容的化學品。藥品柜中間設有隔板，不兼容的化學品可以分開存放。然后確保標貼擺放到位。一、任何化學品一定要有化學品標簽；二、擺放化學品時標簽應朝外，用戶可以直接看到化學品標簽。
為了確保自凈化藥品柜能夠可靠安全的運行，避免存儲的藥品被污物污染，必須清潔維護藥品柜，在清潔時可先用肥皂水清洗，然后再用干凈的水沖洗干凈。
在選用選用柔軟的沒有摩擦性的毛巾擦拭干凈，或者使用PH值有中性的產品清潔，再用無腐蝕性的軟布擦干，另外我們還要隨時注意檢查金部件有無腐蝕現象，檢查層板上是否有液體滯留，如果有需要等層板也進行清理。
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